в Самаре сезонные работы перед месячником по благоустройству продолжаются в активном режиме
Дата: 13.03.2020 11:39
К масштабному преображению в рамках традиционного месячника по благоустройству уже готовят городские территории — сезонные работы усилены. Также в активном режиме предприятия транспортной отрасли наводят чистоту в общественном транспорте, особое внимание уделяя его санитарному содержанию.
Так, в парке предприятия «Самара Авто Газ», осуществляющего пассажирские перевозки по муниципальному заказу и муниципальным маршрутам, — 450 машин. Все автобусы регулярно проходят процедуру очистки и обработки (дезинфекции).
«Ежедневно моется каждая машина предприятия. Как правило, либо рано утром, либо поздно вечером автобусы заезжают в специальный ангар для водных процедур, — рассказала пресс-секретарь транспортной компании Анна Замыцкая. — В ходе рейсов также каждый кондуктор следит за чистой внутри салона, а водитель отвечает за санитарное содержание кабины».
На базе предприятия оборудованы две установки для мойки, оснащенные специальными вращающимися щетками. Помогают обслуживать подошедший на санитарную обработку общественный транспорт сотрудницы моечной станции. Сначала они щетками с помощью мыльного раствора вручную тщательно очищают машину снаружи и под напором воды смывают уличную грязь, удаляя ее и с труднодоступных участков. Кроме того, чистоту в ЛИАЗах, МАЗах и ПАЗах наводят и внутри салонов — моют полы, окна, протирают поручни, спинки сидений.
«Стараемся захватить все поверхности, с которыми контактирует пассажир, чтобы было чисто, уютно и красиво. Мы сами ездим на этих же автобусах, поэтому мы стараемся», — пояснила Раиса Камеева, мойщик-уборщик подвижного состава.
Отметим, что при наведении чистоты в салоне автобуса используют безопасную противобактериальную жидкостью. Химический состав одобрен Роспотребнадзором. Препарат не содержит хлора и выпускается российским производителем. Уборка с использованием такого средства внутри салонов особенно важна в периоды респираторно-вирусных заболеваний.
Завершающий этап уборки каждого автобуса — вертикальная автоматическая мойка, через которую проходят машины.
Вместе с тем в преддверии городского месячника по благоустройству предприятием уже проведена генеральная уборка территории базы и офисных помещений АТП “Самара Авто Газ”. В ближайшее время силами сотрудников предприятия планируется навести порядок и в таких местах стоянки автобусов, как разворотные площадки – там соберут скопившийся за зиму мусор.
Подчеркнем, что санитарное содержание общественного транспорта находится в зоне повышенного контроля на всех профильных предприятиях. Например, с тем, как эти обязательные работы организованы в МП г. о. Самара «Самарский метрополитен», можно ознакомиться на официальном сайте Администрации Самары – по ссылке: https://www.samadm.ru/media/news/24095/
.
От чего зависит чистота в городе?
Приятно гулять по чистым ухоженным улицам, дышать свежим воздухом в парках и скверах, смотреть, как детвора играет на благоустроенных детских площадках. Что нужно сделать, чтобы так было всегда?
Конечно, проблему чистоты и благоустройства города можно всегда сбросить на городские и коммунальные службы, которые отвечают за уборку. Но все забывают про золотое правило: чисто не там, где убирают, а там, где не мусорят.
Раздражает, когда каждый день приходится буквально переступать через груды хлама возле своего дома, дачи или парка. Идя на работу, замечаешь как «сознательные» граждане бросают пакет с мусором в городские урны, которые расположены в парках, скверах, остановках общественного транспорта, а то и вообще выбрасывают в кустарники рядом с домом. Такую ситуацию можно наблюдать в каждом микрорайоне города. На замечания отвечают грубостью.
Обычный мусор, который часто принято называть «бытовым», — это не только пластик, металл и стекло, но также и батарейки, ртутные лампы, электроприборы, которые могут нанести большой вред окружающей среде, а в дальнейшем и здоровью проживающих рядом людей.
И главный парадокс в том, что немалую лепту в это «грязное дело» вносим мы сами!
Для чистоты в городе и так много делается. Ежедневно коммунальными службами города выполняются работы по уборке улиц, скверов, парковой зоны. Очищаются от мусора городские урны, убираются остановки общественного транспорта. С организованных мусоросборников города вывозится мусор. Представляете, что было бы, если бы всего этого не делали? Город просто утонул бы в обертках, сломанных вещах, кухонных очистках и прочих отходах!
В Березовском ежедневно все подрядные организации отчитываются о проделанной работе с фото и видеофиксацией. Мойка дорог, поливка и уход за цветниками, спил аварийных деревьев, окос газонов, установка знаков дорожного движения, установка и ремонт лавочек – это только малая толика проводимых ежедневных работ. Качество работ контролируют специалисты МКУпоУЖКХ и заместитель главы города по ЖКХ.
Как поддерживать чистоту в ванной без усилий? / Советы эксперта / Cersanit
Ванная комната – это помещение, которое ассоциируется с чистотой и свежестью. Однако уборка занимает довольно много времени и считается скорее процессом обременительным, чем радостным. Неудивительно, ведь чтобы обработать большую площадь с множеством укромных уголков нужно приложить много усилий и затратить еще больше времени. В нашей статье мы расскажем, как это изменить!
Секрет чистой ванной комнаты
Настоящий секрет идеально чистой ванной комнаты – это эргономика. Поэтому о длительном поддержании чистоты мы должны подумать уже на этапе планирования интерьера. Правильная расстановка мебели и сантехники минимизирует количество труднодоступных мест, делающих уборку утомительной. Чтобы облегчить борьбу с грязью и в то же время визуально увеличить ванную комнату и добавит ей «легкости», рекомендуем выбрать подвесные модели мебели и санфарфора для ванной комнаты, например, из коллекций MODUO
или CREA. Гладкие фасады шкафов и простые, минималистичные формы раковин, унитазов или биде достаточно протереть губкой с моющим средством для достижения желаемого эффекта.
Чистая ванная комната и современные технологии
Если вы хотите убираться в санузле быстро и без особых хлопот, делайте ставку на современные технологии. На рынке санитарных изделий можно найти раковины, ванны и унитазы, спроектированные и изготовленные так, чтобы ванная комната оставалась чистой как можно дольше. Например, раковины из коллекции CREA
не только легкие и прочные, они покрыты очень гладкой эмалью, что препятствует оседанию грязи, водного камня или мыльного осадка, которые при необходимости будет легко удалить с поверхности. Также отличным решением будет любая из акриловых ванн Cersanit, изготовленных из 100% английского литьевого акрила, покрытие которых предотвращает образование неэстетичных потеков, полос и пятен. При покупке унитаза стоит выбрать вариант без ободка, чтобы избавиться от необходимости чистить труднодоступные места, в которых накапливаются бактерии. Технология Clean On унитазов марки Cersanit позволяет поддерживать чистоту без использования агрессивных моющих средств. В комплекте с санитарными изделиями рекомендуется использовать антибактериальное сиденье для унитаза из коллекций STREET FUSION, CITY или CARINA, которое поможет в борьбе за чистоту и гигиену.
Плитка для ванной комнаты, которая облегчит уборку
Если вы не хотите после каждого приема ванны или душа полировать плитку на стенах и полу ванной комнаты, избавляясь от потёков и отложений камня, выбирайте светлые коллекции с гладкой глянцевой текстурой, такие как PUDRA или EVOLUTION. На глянцевой поверхности грязь менее заметна. Аналогичного эффекта «продолжительной чистоты» можно достичь, выбрав плитку с рисунком или мелким узором. Не забудьте позаботиться и о правильном цвете затирки для межплиточных швов. Важно, чтобы она соответствовала цвету плитки, но оттенок не был слишком светлым. Дополнительно пропитайте швы водоотталкивающим средством для предотвращения быстрого загрязнения и выцветания.
Стерильность и чистота в стоматологии – новости и статьи Refformat
важно чтобы стерильность в стоматологии была абсолютно во всем: в зубоврачебном кабинете, в инструментах и стоматологических материалах, в руках врача и ассистента, в оборудовании, в воздухе и даже предметах обстановки.
Полость рта человека обильно заселена микроорганизмами инфекционной, бактериальной и грибковой природы. Они содержатся не только в разрушенных зубах или окружающих их тканях, но и в слюне, а часть из них проникает в кровь. По этой причине важно чтобы стерильность в стоматологии была абсолютно во всем: в зубоврачебном кабинете, в инструментах и стоматологических материалах, в руках врача и ассистента, в оборудовании, в воздухе и даже предметах обстановки.
Как добиться чистоты в стоматологии?
Для предупреждения попадания в рану, органы и ткани пациента микроорганизмов разработан комплекс асептических мероприятий. В них входит дезинфекция санируемой области, оборудования и воздуха кабинета, стерилизация инструментария, рук персонала, шовного и перевязочного материала, имплантов, тканей и веществ, вводимых в рану больного.
Чистота в стоматологии поддерживается за счет:
- регулярной влажной уборки, кварцевания воздуха кабинета;
- механической очистки и стерилизация материалов и предметов, которые контактируют с полостью рта пациента, термическим или химическим методами;
- хранения стерильного инструментария в боксах, оснащенных УФ-лампами;
- работы персонала в стерильных резиновых перчатках, масках и форменной одежде.
С целью предотвращения воздушно-капельного и контактного инфицирования пациентов все сотрудники регулярно проходят медицинские осмотры, в которые в обязательном порядке входит флюорография и микробиологический анализ смывов рук и мазков из носоглотки.
Стерильность в клинике Refformat
Перед началом работы с пациентом в нашей клинике сотрудники всегда моют руки с антибактериальным мылом, а затем обрабатывают их дезинфицирующим составом, и только после этого надевают перчатки. При необходимости они дополнительно обрабатываются дезсредствами, устраняющими опасные микроорганизмы.
Несколько раз в день проводится очистка всех поверхностей в кабинетах и зале ожидания, а раз в неделю выполняется генеральная уборка помещений клиники. Инструментарий, шовный и перевязочный материал хранится в ультрафиолетовых бактерицидных установках, поддерживающих стерильность на протяжении 12 часов. После каждой работы с пациентом использованный инструментарий подвергается предстерилизационной обработке, а после этого холодной или термической стерилизации.
Любой пациент нашей клиники может ознакомиться с перечнем оснащения клиники, документацией, подтверждающей ежедневно проводимые мероприятия по поддержанию стерильности, а также задать интересующие вопросы по телефону +7-926-403-84-44.
К списку постов
Чистота в кафе и ресторанах
В воспоминаниях о своих любимых заведениях в разных городах мира вы наверняка не найдёте липких столов, жирных столовых приборов, неприбранных туалетных комнат, пятен на скатертях или обивке… Мы очень трепетно относимся к чистоте. Респонденты многочисленных социологических опросов сообщают, что никогда не возвращаются в кафе или ресторан, где что-то вызвало у них брезгливое чувство. Для опрошенных европейцев чистота более значима, чем сервис, средний чек и местоположение заведения. О неаккуратных сотрудниках, испортивших впечатление от обеда или ужина, более 20% гостей обязательно пишут в соцсетях или на сайтах для путешественников, что плохо для репутации любого кафе или ресторана.
Кто отвечает за чистоту
На кухне за чистоту помещения, оборудования, всех предметов и приспособлений, за удаление мусора и состояние ёмкостей для него отвечает отдельный сотрудник. Он моет полки, холодильники и шкафы, чистит печи, плиты, пароварки, а также контролирует все моющие механизмы и оборудование, своевременно сообщая о неисправностях.
За состоянием мебели и оборудования в зале ресторана следит администратор. Порядок и чистота в зале и входной зоне – его зона ответственности. Чистоту столиков, пола, скатертей, мебели контролируют стюарды, официанты и администратор – они первыми реагируют на возникшие проблемы.
Чистота бара и прилегающих к нему помещений – под контролем бармена.
Администратор и сушеф (или специально назначенные ответственными за уборку заведения сотрудники) составляют подробное описание всех зон ресторана: от парковки и входной группы до туалетных комнат и запасных выходов – и пишут подробные инструкции, позволяющие каждому из сотрудников усвоить алгоритмы уборки кафе или ресторана (не просто что мыть, но и как это делать).
В некоторых заведениях принята практика раз в четыре недели составлять карту уборки, в которой в виде таблицы выведены все ежедневные, еженедельные и ежемесячные (или производимые два раза в месяц) уборочные процедуры. На собрании смены администратор, директор или сушеф рассказывают об уборочных мероприятиях, которые сотрудники должны выполнить в течение смены.
Заполненный бланк карты уборки каждый вечер вывешивается на информационный стенд, и в течение следующего дня в таблицу вписываются данные о времени выполнения всех уборочных работ.
Как получается чистота
Чтобы заведение выглядело безупречно, не обойтись без ежедневной уборки всех помещений. Каждый сотрудник на своём месте уделяет внимание этому аспекту, чтобы рабочее пространство оставалось комфортным.
На кухне необходима периодическая мойка духовых шкафов, холодильников и вытяжек, обезжиривание рабочих поверхностей, дезинфекция сливных отверстий. В процессе уборки используют специальные моющие средства, безопасные для здоровья персонала.
Уборку кухни производят во время рабочего перерыва. Чистота должна поддерживаться здесь в течение всего дня!
В зале и входной зоне уборка производится в нерабочее время. Обязательны влажная уборка, периодическая чистка мягкой мебели, элементов декора и напольных покрытий, удаление мусора, обеспыливание. Особое внимание следует уделить входной двери, а также зеркальным и стеклянным поверхностям. Важно не забывать чистить радиаторы, обеспыливать плинтусы, розетки, выключатели.
Зал и вестибюль убирают по утрам (до начала приёма гостей) и вечером после закрытия. В больших ресторанах утреннюю уборку следует заканчивать не менее чем за шесть часов до прихода первых гостей, чтобы в зал могли войти официанты, отвечающие за подготовку к приёму посетителей. Уборка в вечернее время выполняется сразу по выходе последних гостей. Она необходима большим заведениям и тем кафе, где предусмотрены завтраки. Важно очистить столики, удалить случайные загрязнения, пятна, проконтролировать состояние растений, проветрить зал.
В туалетных комнатах контроль за чистотой необходим в течение всего дня. Важно не только мыть, но и дезинфицировать поверхности, в том числе полы. Обязателен постоянный контроль за восполнением расходных материалов: туалетной бумаги, мыла в диспенсерах, полотенец, освежителей воздуха и пр. График уборки туалетной комнаты заполняют сотрудники, осуществляющие уборку.
О генеральной уборке и профессионалах
Раз в месяц заведению требуется генеральная уборка. Она не потребует от персонала подвигов, если в кафе или ресторане ежедневно поддерживалась чистота – некоторые предприятия даже отказываются от практики генеральных уборок. Однако, чем заведение больше, тем серьёзнее объёмы необходимых уборочных работ.
В процессе генеральной уборки тщательно моются вывески, все полы, окна и рамы, производится химчистка мягкой мебели, ковров, чехлов и, если надо – скатертей и салфеток. Осуществляется мытьё посуды, всего кухонного оборудования.
Собирается и вывозится мусор, очищаются грязеулавливающие коврики, вентиляционные системы.
Нередко заведение нуждается в профессиональной уборке с привлечением специального клинингового оборудования, профессиональной химии и специалистов, которые умеют быстро и эффективно бороться со специфическими загрязнениями, обращаться с дорогими элементами интерьера и отделочными материалами.
Профессиональный клининг позволяет предприятиям сектора HoReCa сохранять безупречный внешний вид, продлевает срок службы ковров, обивки, напольных покрытий, мебели. Правильный уход за помещением в итоге позволяет экономить на текущем и капитальном ремонте.
Чистота в перспективе
В краевом центре идет реализация дорожной карты по раздельному сбору твердых коммунальных отходов (ТКО).
Проект, который администрации Хабаровска предложили экологические активисты, одобрил мэр Сергей Кравчук. Спустя полгода действия инициативы можно подвести первые итоги.
Говорящие цифры
— Полным ходом идет работа по установке контейнерных площадок для раздельного сбора мусора, — говорит председатель хабаровского краевого отделения Всероссийского общества охраны природы Владимир Сидоров. — На них появилось еще 50 емкостей. Радует, что к реализации дорожной карты подключаются различные предприятия, участники проекта «Принеси пользу своему городу». Они помогают устанавливать контейнеры для сбора стекла, ПЭТ-бутылок. В планах оборудование объектов под металл и алюминиевые банки.
Сейчас в краевом центре около 300 площадок, где сортируют ПЭТ-бутылки и макулатуру.
— На сегодняшний день это основные фракции, — продолжает Владимир Сидоров. — Еще порядка 20 контейнеров предназначены для сбора стекла, а на станцию «Поляна» можно сдать 15 разных категорий: «добрые крышечки», батарейки, люминесцентные лампы, несколько видов пластика, алюминий, железо, электронный лом, стекло. Количество людей, которые приходят туда, стабильно растет. Мы выходим на показатель в 15 тысяч горожан, которые приезжают к нам регулярно. Помимо дворовой инфраструктуры для сбора мусора, городу нужны станции для более глубокой сортировки. Мы ежемесячно проводим акции, во время которых хабаровчане сдают нам полиэтилен и полипропилен. Недавно такое мероприятие впервые состоялось рядом с «Леруа Мерлен». Граждане активно собирают дома эти виды пластика, и нам приятно, что они так ответственно подходят к делу, не выбрасывают, а ждут наши акции.
В крае оборудовано 346 контейнерных площадок для раздельного накопления твердых коммунальных отходов. По данным МинЖКХ, ежемесячно около 55 тонн пластика и 115 тонн бумаги отправляется на переработку.
Игрушки да лавочки
Развивается сотрудничество с предприятиями региона.
— Вместе с ними мы организуем просветительские проекты, проводим экскурсии на производствах, — рассказывает Владимир Олегович. — Для многих людей настоящая новость, что в крае, оказывается, есть перерабатывающая промышленность. Некоторые даже считают, что никакой сортировки отходов нет и все, что мы собираем, затем сбрасываем в одну кучу. Очень тяжело перебороть этот миф. Хабаровчане, которые взаимодействуют с нами длительное время, понимают, что хорошее, чистое и качественно отсортированное сырье никогда не окажется на свалке, так как обладает высокой экономической ликвидностью. Мы всегда отправляем каждый вид отходов туда, где его готовы принять. Сегодня в городе работает завод по производству картона, и он очень востребован. Предприятие «Полимер-ДВ» производит мусорные пакеты из вторсырья, а стекло направляется в Новосибирск, где его переплавляют для новых изделий. К сожалению, у нас в городе нет линии по переработке ПЭТ-бутылки. Эту фракцию пересылаем в другие регионы. А между тем из нее производят гранулы для производства новых бутылок и делают флис-волокно — это то, чем набивают мягкие игрушки и пуховики. В крае также есть две организации, которые производят лавочки и террасную доску из полиэтиленового сырья. Многие уже видели такие скамейки, они стоят в дендрарии.
Внимание просветительской работе в области обращения с ТКО сейчас уделяется особенно много. Соответствующую информацию можно найти в инстаграм-аккаунте @rsbor_khv.
— Мы регулярно выкладываем туда публикации, касающиеся наших акций и раздельного сбора. В рамках дорожной карты отработали очень важный спецпроект — «Секреты переработки». Это пособие для школ и образовательных учреждений, по которому занимаются дети. Уже проведено 15 занятий в тестовом режиме совместно с центром «Косатка» и городским эколого-биологическим центром. Они одобрили приобретение просветительского комплекса для школ, — отметил Владимир Сидоров.
Все желающие могут стать участниками бесплатного приложения «Сортируй и спасай», которое можно установить через AppStore или PlayMarket.
Двигаемся дальше
В вопросе экологии важно, чтобы власти разных уровней оказывали активистам всестороннюю поддержку.
— Большие проекты без этого даются непросто. Но в нашем городе многое делается на муниципальном уровне, — говорит Владимир Олегович. — Важным достижением в рамках дорожной карты стало решение создавать станции раздельного сбора ТКО на общественных пространствах по программе «Комфортная городская среда».
Мы обсудили этот вопрос с мэрией и договорились, что площадки обязательно надо оборудовать в парках и скверах, где проводится реконструкция. Горожане сегодня хотят видеть такие объекты не только во дворах. Уже разработано несколько типовых предложений, которые могут войти в проекты благоустройства в 2022 году. Включим их в голосование, чтобы люди сами делали выбор.
Продолжается работа по созданию пунктов по раздельному сбору ТКО наподобие «Поляны».
— В Южном микрорайоне определен участок под новый объект, который расположится рядом с ТЦ «Южный парк». Сейчас прорабатываем техническую документацию, — делится подробностями председатель. — В планах провести
конференцию по раздельному сбору ТКО, а также акцию «Пакет не надо». Все, что прописано в плане дорожной карты, сделаем. Хабаровск уже показал готовность к сортировке отходов, а главное, здесь есть вся необходимая инфраструктура для развития этого направления.
Чистота в помещениях очень важна как для здоровья людей, которые в нем находятся, так и для внешнего вида данного помещения. Поэтому каждая компания обязательно обращает свое внимание на чистоту рабочего помещения. Важна как чистота поверхностей, так и чистота воздуха в помещениях. Соблюдение чистоты воздуха оказывает огромное влияние на уровень жизни каждого человека, который находится в том или ином помещении. Чистота важна абсолютно во всех сферах деятельности людей. Это касается:
Приобрести необходимые средства и оборудование для чистоты помещения можно на сайте https://aroterra.ru/. На данном сайте можно найти широкий ассортимент данных товаров по очень привлекательной цене.
На данный момент, в связи с развитием пандемии, особенно важно соблюдать гигиену помещения, воздуха, а также личную гигиену. Это необходимо для того, чтобы обеспечить безопасность для всех людей и снизить распространение коронавируса.
Как всем известно, очень важно соблюдать гигиену рук, ведь коронавирус в первую очередь передается контактно-бытовым путем. Именно поэтому, на данный момент во всех общественных местах устанавливают дозаторы с антисептическими средствами. Здесь на данном сайте можно найти широкий ассортимент дозаторов для антисептических средств и мыла. Благодаря этому, каждый сможет подобрать себе наиболее подходящий вариант. Перед тем, как решиться на покупку, желательно начать разбираться в данном вопросе и хотя бы быть в курсе того, какие виды дозаторов существуют на данный момент времени, чем они отличаются друг от друга. Особенно популярны на данный момент сенсорные дозаторы. Они позволяют снизить контактирование с окружающей средой.
На сайте компании Аротерра можно найти подробное описание каждого товара. Благодаря этому, вы сможете разобраться с тем, какой вариант будет наиболее оптимальным. Во время выбора дозатора, необходимо обращать свое внимание на следующие моменты:
Также на сайте данной компании можно найти различные виды баков для мусора. Баки для мусора очень помогают сохранить чистоту в помещении. На данный момент существуют различные виды баков для мусора, с которыми можно ознакомиться на сайте компании Аротерра. В каталоге данной компании можно найти модели, которые предназначаются для хранения и сортировки разных видов отходов.
|
Определение чистоты Merriam-Webster
пу · ри · ти
| \ ˈPyu̇r-ə-tē
\
1
: качество или состояние чистоты
Что такое чистота и почему это важно?
Чистота не пользуется популярностью.Подумайте об этом: когда вы в последний раз слышали это слово в предложении? Если вы не работаете ювелиром, вероятно, прошло довольно много времени. И когда мы говорим о чистоте, большинство людей думает, что это относится только к сексуальности. Более пристальный взгляд показывает, что сила чистоты влияет на каждую часть вашей жизни — и жизни других — как сейчас, так и в вечности.
Что такое чистота?
Так же, как чистый означает «не грязный», вы можете определить чистоту как «отсутствие загрязнений». Но это описание не очень помогает представить, как выглядит чистая жизнь.Вместо этого посмотрите на это так: Чистота описывает, кто вы и что вы делаете. Это относится как к вашему характеру, так и к вашему поведению, особенно когда вы один.
Итак, что должно относиться к вам, если вы стремитесь к чистоте?
1. Хочешь угодить Богу
Вы желаете угодить Богу в своей жизни, боясь Его, поклоняясь Ему, повинуясь Ему, лелея Его и любя Его. Настоящая чистота приходит в результате веры в то, что Господь Иисус умер вместо вас, чтобы искупить вас от нечистоты.Чистая жизнь возрастает по мере того, как вы работаете вместе со Святым Духом, чтобы жить как искупленное дитя Божье.
Чистота описывает, кто вы и чем занимаетесь.
2. Вы выбираете прозрачную жизнь
Ваша забота о правде побуждает вас продемонстрировать свою порядочность, честность и прозрачность. Как чистый человек, вы желаете чистой и полной жизни, свободной от коррупции и компромиссов. Ваше стремление к чистоте побуждает избегать соблазнов, которые могут осквернить или ослабить ваш характер, и сопротивляться им.
3. Ваши действия подтверждают хорошее
Ваши решения согласуются с тем, что вы считаете правильным и превосходным. Вы цените красоту и скромность в стиле и внешнем виде. Вы чтите свое тело и Господа, который искупил его, демонстрируя честность и самообладание в своем поведении.
Борьба за чистоту помогает вам стремиться к безупречной репутации перед Богом и другими, что выражается в ваших словах и действиях. Вы искренне цените то, что свято для Бога и достойно в глазах других.
4. Любите других и оставайтесь скромным
Вы цените мир с другими, служите им бескорыстно и жертвенно с любовью и уважаете их как личностей, созданных по образу Бога, а не как объекты, которые нужно использовать для вашего удовольствия. Ваша чистота не должна вызывать у вас гордость или заставлять смотреть свысока на других, сделавших иной выбор.
Ваша чистота не должна заставлять вас гордиться или заставлять смотреть свысока на других.
Испытания очистили и испытали вашу чистоту, и вы становитесь все более похожими на Господа Иисуса каждый день.Вы понимаете, что чистая жизнь — это постоянное стремление на протяжении всей жизни и что вы не достигнете совершенства в этой жизни. Ваше стремление к чистоте делает вас смиренным и зависимым от Божьей силы, освящающей вас.
Слишком хорошо, чтобы быть правдой?
Кажется ли это видение чистоты нереальным или недостижимым? Хотя никто из нас никогда не достигнет совершенства в этой жизни, мы все же должны стремиться к этому высокому стандарту. Помните, что чистая жизнь — это марафон на всю жизнь, а не спринт по принципу «все или ничего».
Почему важна чистота?
Purity дает вам несколько важных преимуществ.Не стоит недооценивать его ценность для вашей жизни или негативные последствия нечистоты.
Чистая жизнь приносит пользу не только вам, но и вашим близким.
Самым значительным преимуществом чистоты является то, что она позволяет вам войти в святое присутствие Бога. В Библии сказано: «Блаженны чистые сердцем, ибо они Бога узрят» (Матфея 5: 8). Эта вечная жизнь возможна только при получении прощения грехов через веру в Иисуса Христа.
Что еще делает чистота в вашей жизни?
- Способствует осторожности, проницательности и правильному выбору, предотвращая коррупцию в мыслях, словах и делах.
- Поддерживает крепкое здоровье и долгую жизнь, ведет к удовлетворению и покою.
- Подчеркивает ошибки в вашей жизни и побуждает к благочестию, почитая совесть, которую дал вам Бог.
- Вдохновляет вас избегать камней преткновения и помогает жить без вины и сожаления.
- С уважением и любовью взращивает сообщество любящих людей.
- Управляет вашими отношениями с другими людьми, особенно с дополнительным полом, и позволяет вам подавать им пример для подражания.
Стремление к чистоте и ее поддержание влияет на все аспекты вашей жизни. Чистое сердце проявится в ваших мыслях, словах, выборе, отношении, отношениях и многом другом. Помните, что ваша чистая жизнь приносит пользу не только вам, но и вашим близким.
Обязательно прославляй Господа Иисуса Христа, «Который предал Себя за нас, чтобы искупить нас от всякого беззакония и очистить для Себя народ в свое владение, ревностный к добрым делам» (Титу 2:14)
purity
Оксфордский словарь английского языка
определяет чистоту как «качество
или состояние чистоты: состояние несмешивания… свобода от манеры
что загрязняет, оскверняет, развращает или унижает; физическая чистота ».
характеристика включает два ключевых компонента; идея чистоты, которая
обобщенно и категорически противопоставляет себя «смешиванию», а идея
чистоты как желаемый и идеализированный атрибут. Таким образом, мы можем обсудить
концепция чистоты и как оценочное суждение, и как описание
естественное состояние объекта (идеи).
В этом определении чистота — это не просто объективно «несмешанное» состояние,
ибо подразумевается конкретное и определенное оценочное суждение.Чистота несет
с его четкими представлениями о пользе, добре и желании, в то время как его противопоставление
состояние (состояние смешанности) характеризуется как бездна подлости.
Определение развивает идею общей чистоты, описывая
возможные области, в которых может появиться чистота (и ее противоположность, нечистота);
данную вещь можно описать как чистую на сексуальном, физическом или моральном уровне.
Чистота как естественное состояние также является неотъемлемой частью этого определения;
для смешивания, подделки или искажения — все действия, требующие извне
агентство.Если эти действия являются причиной нечистоты, тогда чистота — это
состояние объекта / идеи до вмешательства таких внешних
силы, его состояние, если оставить его в естественном, уединенном, невозбужденном состоянии.
Такое приписывание чистоты руке природы подчеркивает
и подчеркнуть общественные суждения, которые в равной степени подразумеваются при использовании
слова. Природа наделяет авторитетом ценности, поддерживаемые обществом.
структура, в которой чистота обозначается как «хорошая», а примеси или смеси — как «плохие».
Идеи чистоты в средствах массовой информации, кажется, основаны на двух общих
формы. Чистоту можно найти либо в полном отрицании среды.
или, наоборот, полное принятие этого медиума как формы и
содержание объединено. Использование и акцент на медиа-формах можно, следуя
доктрины, разработанные, например, Гринбергом и абстракционистами,
привести к чистоте в выбранной среде. Однако, согласно Платону и
Кант, любое использование средств массовой информации может испортить и испортить чистоту
интеллектуальные идеи.Кажется, что чистота склонна к крайностям, как и
можно ожидать от идеи, содержащей такую внутреннюю бинарную оппозицию
(смешанные / несмешанные, чистые / загрязненные и т. д.) Чистота абсолютна; нельзя быть
в основном чистый или почти несмешанный. Чистота — это принцип «все или ничего».
Пожалуй, классический образец чистоты как идеального и
понятие встречается в трудах Платона. Его мир форм — мощный
пробуждение идеала чистоты. В «Федре» Сократ описывает верхнюю
царство истины и разума, где формы существуют и могут быть восприняты
действительно.Однако полное видение истины (и Красоты,
и Справедливость и т. д.) доступна не всем душам, а только богам.
Люди могут мельком увидеть эти истины через искусство или обсуждение,
но такие медиа могут быть только теневыми копиями чистых и истинных Форм. В
Формы представляют собой несмешанную, неповрежденную правду о мире, которая
все больше искажаются / искажаются / становятся нечистыми через средства массовой информации, которые люди
должны использовать для объяснения и представления этих истин.В его философии
единственная возможность для истинной чистоты существует в интеллектуальном дискурсе,
и царство идей. Интерпретация чистых идей, чистых форм в
любая физическая реальность, будь то живопись или скульптура,
или даже просто писать, по сути проблематично,
и неминуемо осквернит чистоту рассматриваемых идей. Платон противостоит
СМИ в принципе из-за их неспособности когда-либо по-настоящему воспроизвести правду
и интенсивность чистых идей. СМИ максимально приближены к чистоте
прозрачная, поэтому он предпочитает речь письму — она более непосредственная,
и общение между двумя людьми менее подвержено проблемам и
путаница в посредничестве, которая возникает, когда идеи записываются в письменном виде
текст.Тем не менее, несмотря на его возражения, Платон — автор и пользователь.
СМИ. Само его отрицание СМИ по теоретическим соображениям служит
практическое доказательство их необходимости и важности, поскольку он должен использовать их
чтобы передать свое презрение.
Иммануил Кант, писавший гораздо позже, также разделяет эту концепцию.
чистоты, которая находится в интеллектуальной (не физической) сфере. Интеллектуальный
чистота характеризуется интуитивными качествами. Геометрия может быть чистой
потому что мы немедленно воспринимаем формы и их отношения, не нуждаясь в
любые грязные доказательства или эксперименты.Наше понимание не связано с
физический (нечистый) мир. Чистое восприятие, чистые идеи, чистое понимание
чисты, потому что пришли к спонтанному, а не эмпирическому
процессы. Идея чистоты отражает, насколько это возможно, отрицание
медиа-формы, так как чистое восприятие происходит интуитивно,
и немедленно, без вмешательства или необходимости в средствах массовой информации.
Однако в искусстве, сферах, связанных с медиа, концепция
чистоты сыграла иную роль.Нежелание или неспособность уволить все
форм посредничества как изначально нечистых, художественная критика имеет историю
попытка определить чистоту в данной среде. Смешивание, которое
следует избегать смешения не интеллекта и телесности, а смешения
различных типов СМИ в конгломераты, игнорирующие их индивидуальную «чистую» идентичность.
В книге Лессинга Laocoon автор пытается продемонстрировать четкое, качественное
различия и границы между живописью и поэзией, границы которых, если
строго соблюдается, будет производить лучшие (более чистые) формы обеих сред
типы.Лессинг и теоретики искусства после него не пытаются представить
средний прозрачный или несуществующий, как мог бы Платон, но вместо этого ищите
для определения характеристик этой среды.
Клемент Гринберг и абстрактные художники, которых он защищал
также сосредоточили свои усилия на достижении чистоты в контексте искусства
СМИ. Они утверждали, что на самом деле это, по сути, озабоченность и
сосредоточьтесь на самой физической среде, которая производит чистое искусство.Абстракция
стал способом, позволяющим художникам дистанцироваться от предмета,
что подчеркнуло прозрачность визуальной среды и сделало ее зависимой
и подчиняться литературе. По словам Гринберга, акцент на содержании
означало, что уникальные физические свойства живописи игнорировались, чтобы
рассказать историю или представить сцены, цели, которые должны принадлежать исключительно
к литературе. Реалистичные стили живописи, направленные на иллюзию — на репрезентацию.
настолько убедительно, что зритель не осознает, что его зрение
был опосредован.Художники отказались от натурализма, чтобы работать с формой, цветом и
пространство, охватывающее саму физическую сущность плоской поверхности и
техники рисования, в которых форма важнее содержания. Гринберг написал
что для того, чтобы картина достигла отделения от литературы и
чистота своей собственной природы требовала «бегства от идей». ( В направлении
A Newer Laocoon) Тема была сделана неуместной, и внимание было изменено.
к самой среде. Чистые Формы Платона, конкретные идеи Истины, Красоты,
Любовь и т. Д.заменяются чистыми формами, которые ничего не представляют, чьи физические
присутствие является одновременно причиной и смыслом их существования. Планарный
поверхность холста, которую изобразительные живописцы
ранее работал над виртуальным стиранием с помощью перспективы,
стала доминирующей чертой во многих абстрактных искусствах. Плоскость этих работ
отражает идеалы чистоты Гринберга, воплощенные в медиуме.
Майкл Фрид также затронул вопросы чистоты СМИ.Он возражал против минималистской художественной школы, чьи работы пытались достичь
статус неискусства, преувеличивая и принимая материальность
работа, исключая что-либо еще. Фрид утверждал, что вместо этого
достижения чистоты своими усилиями эти буквалисты изначально создали
смешанные театральные инсталляции, где присутствует объект / искусство
и его взаимодействие со зрителями так же важно (если не более важно)
чем сам физический объект.Таким образом, само внимание к материальности в
эта крайняя теория ведет не к чистоте, а к противоположности искусства и
художественная чистота, которая есть театр. Фрид пишет, что «то, что лежит между
искусство есть театр ». (Искусство и объектность) Буквальные инсталляции
не удается достичь чистоты, например, художников-абстракционистов или скульптора
Энтони Каро из-за отсутствия художественных различий между
искусство и объект. (см. объектность)
Таким образом, чистая живопись становится живописью, которая касается
с актом живописи и качествами картины (цвет, текстура,
и т.п.) Исследование этих идей авангардом открывает возможность
для разных типов чистоты — чистая поэзия, например, чиста для разных
Причины, по которым абстрактная картина считается чистой. «Чистая поэзия» вообще
относится к идеалам, описанным По, Бодлером, Малларме и
Валери. Их теории призывают сделать упор на лиризм и музыкальность.
для оказания эмоционального и психологического воздействия; идеалы, которые
очень отличается от физических, пластических идеалов, которых придерживаются абстрактные художники.Таким образом, в различиях между медиа мы видим возможность
различные подходы и примеры чистоты. Платоновская концепция единого
воплощение чистоты — чистоты как интеллектуальной и духовной конструкции — это
уволен в интересах различных медиа-форм.
Однако есть одна неотъемлемая проблема с чистотой.
как у Платона, так и у более поздних абстрактных художников. Это вопрос ценности.
Для обеих теорий чистоты (чистота внутри среды и чистота против среды)
действуют, исходя из предположения о положительных ценностях, неразрывно связанных с чистым
формы.Эта настойчивость в ценности чистоты мгновенно отрицает любую возможность
для мощного искусства в намеренно смешанной среде. Если смешивание всегда приравнивается
с осквернением, то какой цели служат намеренные попытки?
переходить границы, так жестко установленные теоретиками? В мышлении
В этом вопросе важно отметить в подавляющем большинстве случаев сексуальные
контекст, который в нашем обществе имеют тенденцию обсуждать чистоту.
Вопросы чистоты связаны даже больше, чем искусство.
с сексуальностью, сфера, где положительное и отрицательное, возможно, не совсем
такая же конкретная, как и противостояние чистое / грязное, хорошее / плохое, которое наблюдалось до этого момента.В то время как исторически чистота занимала освященное положение (пуританин
На ум приходят принципы целомудрия) сегодняшнее отношение явно более амбивалентно.
Современные женские журналы (которые могут быть китчевыми, но тем не менее отражают
некоторая общественная правда) содержат статьи о том, как быть половым котенком,
а популярные фильмы, такие как « Американский пирог », прославляют поражение чистоты. Чистота делает
действительно несут положительный оттенок в сексуальной сфере, девственности,
инцидент и т. д.Однако в этом понимании подразумеваются эквивалентные
идеи невежества и упущенных возможностей. Сексуальную нечистоту можно прочитать
либо как коррумпированные (следуя ценностным стандартам эстетиков)
или он может представлять повышенную интенсивность, знания и опыт. Если мы
рассматривать смешанные медиа-проекты через это более неоднозначно и менее четко
осуждающая линза (сексуальности), потенциал для нечистого (но «хорошего») искусства
появляется. Более того, это детально проработанное прочтение самой чистоты может служить
ставить под сомнение сами принципы стандартов, отстаиваемых в прошлом.
Произошла ошибка при настройке пользовательского файла cookie
Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности. Если ваш браузер не принимает файлы cookie, вы не можете просматривать этот сайт.
Настройка вашего браузера для приема файлов cookie
Существует множество причин, по которым cookie не может быть установлен правильно. Ниже приведены наиболее частые причины:
- В вашем браузере отключены файлы cookie. Вам необходимо сбросить настройки своего браузера, чтобы он принимал файлы cookie, или чтобы спросить вас, хотите ли вы принимать файлы cookie.
- Ваш браузер спрашивает вас, хотите ли вы принимать файлы cookie, и вы отказались.
Чтобы принять файлы cookie с этого сайта, используйте кнопку «Назад» и примите файлы cookie. - Ваш браузер не поддерживает файлы cookie. Если вы подозреваете это, попробуйте другой браузер.
- Дата на вашем компьютере в прошлом. Если часы вашего компьютера показывают дату до 1 января 1970 г.,
браузер автоматически забудет файл cookie. Чтобы исправить это, установите правильное время и дату на своем компьютере. - Вы установили приложение, которое отслеживает или блокирует установку файлов cookie.
Вы должны отключить приложение при входе в систему или проконсультироваться с системным администратором.
Почему этому сайту требуются файлы cookie?
Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности, запоминая, что вы вошли в систему, когда переходите со страницы на страницу. Чтобы предоставить доступ без файлов cookie
потребует, чтобы сайт создавал новый сеанс для каждой посещаемой страницы, что замедляет работу системы до неприемлемого уровня.
Что сохраняется в файле cookie?
Этот сайт не хранит ничего, кроме автоматически сгенерированного идентификатора сеанса в cookie; никакая другая информация не фиксируется.
Как правило, в файлах cookie может храниться только информация, которую вы предоставляете, или выбор, который вы делаете при посещении веб-сайта. Например, сайт
не может определить ваше имя электронной почты, пока вы не введете его. Разрешение веб-сайту создавать файлы cookie не дает этому или любому другому сайту доступа к
остальной части вашего компьютера, и только сайт, который создал файл cookie, может его прочитать.
Чистота памяти запаха
Аромат так манит — он переносит нас в другое место, в интимное время и место воспоминаний, пробуждая чувство, внутреннюю эмоцию. Из пяти чувств запах сильнее всего связан с нашей памятью, и благодаря партнерству с Donna Karan Fragrance меня попросили создать историю Eyeswoon о красоте, природе и женственности в честь их нового аромата Donna Karan Liquid Cashmere White, I сразу понял, какими сенсорными (осмелюсь сказать, духовными?) переживаниями я должен был поделиться.
Около 10 лет назад небольшая группа моих самых близких и дорогих подруг собиралась ежемесячно на круг Новолуния. Новолуние знаменует собой начало нового цикла, новое начало и оптимальное время для посадки семян трансформации. Это был заветный вечер, чтобы обозначить намерения, разделить борьбу и отпраздновать нашу женственность. Ритуал был мощным, эмоциональным и преобразующим, предлагая нам священное пространство. Связь и духовный ченнелинг были между нами глубокими, и в эти символические ночи возникла прочная связь (во главе с моей дорогой подругой Миджано, которая с тех пор распространяет свою мудрость на своем магическом сайте Mystic Mamma).Наш блаженный праздник выглядел примерно так: каждый из нас приносил в круг цветы, травы или эфирное масло. Когда мы собирались вокруг неглубокой миски с солью для ванн, каждый из нас говорил обо всем, что нас трогало…. Выражение благодарности, энергия, которую мы стремились высвободить, осознание, которое мы наконец смогли раскрыть. Во время разговора мы предлагали солям наши цветочные лепестки или ароматный элемент, и, замыкая круг, каждый из нас наполнял сосуд этими мощными и эмоционально насыщенными солями.Полнолуние также предложило идеальное время для создания еще одного ритуала: священное омовение с солями, момент отдыха, чтобы мы вспомнили о наших намерениях!
Жизнь с тех безумных ночей стала бесконечно более сложной, неистовой и, конечно, менее обоснованной … Я могу готовить и творить от заката до рассвета для своей семьи, друзей и для Айзун, но когда дело доходит до замедления и поиска момента для себя , Я просто не могу найти время. Знаю, знаю, это плохая отговорка — для тебя всегда есть время.Все мы миллиард раз слышали: «Сначала нужно позаботиться о себе, чтобы быть хорошей женой, хорошей мамой, творческим существом…» Так почему, ну почему, мы игнорируем эти проверенные временем правила ведения сбалансированной жизни?!? Итак, чтобы прийти в себя, я решила принять обильно увлажняющую ванну с молоком, чтобы впитать ее. Это был не только повод для связи с самим собой, но и для создания красоты с помощью ритуала.
При создании этих солей для ванн я черпал вдохновение непосредственно из изысканных сырых элементов аромата Donna Karan Liquid Cashmere White: бергамота, лимона, черной смородины, шиповника, иланг-иланга и ванили.Я проснулся рано и внимательно изучил цветочный рынок, чтобы выбрать цветы, даже акт рисования ванны превратился в тихую паузу в медитации… Я погрузился в трансцендентное чувственное переживание. Хотя фактический конечный результат ванны прекрасен, это поистине ритуальный процесс уделения времени и воспоминаний — редкие тихие моменты, теряемые внутри вас, — вот где можно найти истинную красоту и единство.
Наряду с Liquid Cashmere White контрастирующий и резко противоположный Donna Karan Liquid Cashmere Black вызывает тайну.Двойственность этих ароматов, как и двойственность каждого из нас, заставляет меня падать в обморок! Скоро в продаже…
МНЕНИЕ: Сексуальная чистота — это намного больше, чем стереотипы о «культуре чистоты»
Секс — это развлечение, по крайней мере, я слышал. Как человек, который пытается сосредоточиться на чистоте, когда дело касается всего сексуального, я все еще полагаюсь на информацию из вторых рук.
Для меня стремление к чистоте означает воздержание от секса до тех пор, пока я не выйду замуж, и изо всех сил стараться избегать вещей откровенно сексуального характера, которые могут быть доступны в Интернете или на мероприятиях.Есть много причин, по которым кто-то может решить вести себя подобным образом, но мои мотивы в основном религиозные.
Я считаю, что попытка сохранить сексуальные желания в контексте брака — это для меня способ почтить Бога и защитить планы, которые он может иметь в отношении меня в будущем.
Этот ограничивающий секс образ мышления может во многом походить на концепцию «культуры чистоты». Культура чистоты — это широкий термин, который часто имеет негативный оттенок и используется для обозначения различных взглядов на секс.
Статья Школы сексуального образования 2020 года описывает культуру чистоты следующим образом: «Особое внимание уделяется чистоте женщин и их ответственности за то, чтобы не допустить« спотыкания »их коллег-мужчин. чистоты ».
Далее в статье говорится, что женщины, нарушающие стандарты чистоты, ошибочно рассматриваются как «поврежденные товары; Использованная нечистая женщина, неспособная отдать себя будущему мужу ».
В статье под названием «Олимпийские игры по репрессиям», опубликованной студенческим изданием The Link в Университете Конкордия в 2020 году, мои попытки вести себя сексуально вредны.Автор предполагает, что «прекращение репрессий могло бы помочь людям жить более достоверно и религиозно чисто».
Имея это в виду, я думаю, что важно рассмотреть, всегда ли попытки сосредоточиться на чистоте попадают в негативную сферу культуры чистоты, как описано выше, и не является ли то, как я пытаюсь справиться с сексом, вредным и репрессивным.
Во-первых, однозначно неправильно возлагать непропорционально большую сексуальную ответственность на женщин.Неотъемлемая часть сексуальной чистоты — это личная ответственность, не оставляющая никому места для моих привратников.
Кроме того, здоровый акцент на чистоте в христианском контексте — это не достижение совершенства в собственных силах и затем чувство собственной никчемности, когда мы неизбежно ошибаемся. Такой образ мышления признает, что искупление Христа за наши грехи сильнее наших ошибок. Есть разница между чувством стыда и признанием определенных поступков, которые вы считаете неправильными.
Так почему же я и другие придерживаемся этих строгих сексуальных стандартов? Для меня это во многом связано с силой секса и моими целями в отношениях.
Я считаю, что одна из самых значимых вещей, которую может испытать человек, — это любовь к семье. Последовательная и самоотверженная любовь к моей будущей жене — это не то, что начинается в день нашей свадьбы. Это то, о чем мне нужно знать в настоящем.
Секс — в силу его роли в жизни человека и в браке — является неотъемлемой частью этой цели.
Думаю, все согласятся, что секс имеет огромную силу. Научные и психологические исследования ясно показывают, что секс порождает сильную эмоциональную привязанность, независимо от того, ищете ли вы этого или нет.
Секс, несомненно, является мощной силой в жизни и во взаимоотношениях, и самоотверженная любовь к моей будущей жене так, как того заслуживает каждая женщина, является для меня главной целью. Я хочу, чтобы эти два аспекта моей жизни — секс и будущая семья — взаимодействовали как можно мудрее для меня.
Моя будущая жена заслуживает прочной сексуальной связи, которую нужно установить только с ней. Именно по этой причине я хочу избегать сексуального поведения с любым другим источником, будь то другой человек, порнография, фантазии или что-то еще.
Как и в случае со многими другими стоящими целями в жизни, соблюдать эти стандарты непросто и требует дисциплины. Негативное восприятие культуры чистоты обычно происходит из-за упора на собственные неудачи и стыд, который они вызывают. Однако ценить чистоту — это гораздо больше.
Мое стремление к чистоте сосредоточено не на моих личных недостатках, а на желании уважать силу секса и уважать мою будущую семью.
Чарли Уиллис (он / он) специализируется в области права и государственной политики, а также специализируется на религиоведении. Он является членом Cru и бывшим членом Конгресса IUSG. Как ни странно, он поддерживает сообщество из 150 с лишним домашних животных с собственным правительством.
Метрика на основе энтропии для оценки чистоты популяций отдельных клеток
Обзор ROGUE
Поскольку данные scRNA-seq могут быть аппроксимированы отрицательным биномиальным (NB) или нулевым NB (ZINB) распределением 15,16 , мы рассмотрели использование статистики S (энтропия экспрессии — дифференциальная энтропия распределения экспрессии, как определено в разделе «Методы») для определения степени беспорядка или случайности экспрессии генов.Примечательно, что мы наблюдали сильную взаимосвязь между S и средним уровнем экспрессии (E) генов, тем самым формируя основу нашей модели энтропии экспрессии (модель S – E, Fig. 1b, c). Более того, S линейно связана с E для набора данных Tabula Muris 2 , как и ожидалось (рис. 1b), что характерно для текущих экспериментов с каплями, тем самым демонстрируя NB-природу наборов данных на основе UMI («Методы»). Для гетерогенной клеточной популяции определенные гены будут демонстрировать отклонение экспрессии во фракциях клеток, что приведет к ограниченной случайности их распределения экспрессии и, следовательно, к снижению S.Соответственно, информативные гены могут быть получены неконтролируемым образом путем отбора генов с максимальным S-восстановлением ( ds ) против нулевого ожидания («Методы»).
Чтобы обеспечить прямую оценку чистоты предполагаемых кластеров клеток или популяций, отсортированных с помощью сортировки по флуоресценции клеток (FACS), здесь мы воспользуемся преимуществом широкой применимости модели S – E к данным scRNA-seq и введем количественную меру, ROGUE («Методы»). Интуитивно понятно, что популяция клеток без значимых ds для всех генов получит значение ROGUE, равное 1, что указывает на то, что это полностью чистый подтип или состояние.Напротив, популяция с максимальным суммированием значимых ds даст оценку чистоты ~ 0.
Модель S – E точно идентифицирует информативные гены
Чтобы проиллюстрировать эффективность нашей модели, мы сравнили S – E с другими конкурирующими методами выбора функций (HVG 11 , Gini 13 , M3Drop 12 , SCTransform 17 , фактор Фано 18 и RaceID3 19 ) на данных, смоделированных из распределения NB и ZINB («Методы»).Для честного сравнения мы сгенерировали в общей сложности 1600 наборов оценочных данных с субпопуляциями, содержащими 50, 20, 10 или 1% клеток, и использовали AUC в качестве стандарта для тестирования производительности каждого метода. Примечательно, что модель S – E постоянно достигает наивысшего среднего значения AUC и значительно превосходит другие методы отбора генов во всех тестируемых случаях с различными пропорциями субпопуляций или уровнями обилия генов (рис. 1d и дополнительные рис. 1 и 2). Хотя SCTransform специально разработан для данных scRNA-seq на основе UMI, он показал заметную производительность на наборах данных, распределенных ZINB (рис.1г). В качестве инструмента для идентификации генов, специфичных для редких типов клеток, Джини продемонстрировал повышенную эффективность, когда на субпопуляции приходилось <20% клеток. Напротив, HVG работал лучше в присутствии субпопуляций клеток с большей долей (дополнительные рисунки 1 и 2).
Чтобы проверить наш метод неконтролируемого выбора признаков в реальных наборах данных, мы провели эксперименты с перекрестной проверкой с использованием классификатора случайных лесов (RF) 20 . Мы случайным образом отобрали 70% ячеек из исходного набора данных в качестве эталона и классифицировали оставшиеся 30% ячеек с кластерами, определенными исходными авторами («Методы»).Интуитивно понятно, что наборы генов, обеспечивающие более высокую точность классификации, более значимы с биологической точки зрения 21 . Используя 14 ранее опубликованных наборов данных, полученных как из капельных, так и из полноразмерных протоколов (дополнительная таблица 1), мы продемонстрировали, что наш метод последовательно идентифицировал гены с большей способностью к классификации, когда было выбрано разное количество (30–5000) генов (рис. 1e, f и дополнительные рисунки 3 и 4). В частности, наша модель S – E показала заметное превосходство при использовании меньшего количества генов (30–100), демонстрируя ее чувствительность.Взятые вместе, эти результаты предполагают, что гены, идентифицированные нашей моделью, более информативны и биологически различимы.
Поскольку ожидается, что наборы данных, полученные из одной и той же биологической системы, будут иметь воспроизводимые информативные гены 12 , мы проверили, как ведет себя наша модель энтропии экспрессии, используя технические реплики из разных тканей (дополнительная таблица 2). Примечательно, что гены, идентифицированные с помощью нашей модели S – E, были более воспроизводимы, когда использовались топовые 500–2000 генов (рис. 1g и дополнительный рис.5а – в). Кроме того, мы также рассмотрели четыре набора данных по поджелудочной железе (дополнительная таблица 3), полученных из различных технологий и лабораторий. Эти реальные наборы данных более сложны, чем технические копии, поскольку они включают системные мешающие факторы, такие как групповые эффекты. Несмотря на существенные систематические различия, наша модель неизменно достигала высоких показателей воспроизводимости (дополнительный рис. 5d).
Основная задача отбора признаков состоит в том, чтобы идентифицировать гены, которые наиболее важны для биологической гетерогенности, что может быть применено для последующей кластеризации.Поэтому мы оцениваем производительность модели S – E в контексте неконтролируемой кластеризации с помощью RaceID3 19 , SC3 22 и Seurat 23 . Здесь мы рассмотрели пять общедоступных наборов данных scRNA-seq с метками ячеек с высокой степенью достоверности 6,9,24,25 («Методы»). Эти наборы данных включают клетки из разных линий, популяций, очищенных с помощью FACS, или хорошо охарактеризованных типов (дополнительный рисунок 6 и «Методы»), и, таким образом, могут считаться золотыми стандартами. Чтобы количественно оценить сходство между кластерами, полученными различными методами кластеризации, и метками опорных ячеек, мы вычислили скорректированный индекс Рэнда (ARI) 26 , который ограничен интервалом [0, 1].По количеству признаков мы рассматривали топ-100, 500, 1000 или 2000 генов. Наши результаты показали, что модель S – E обеспечивает лучшую производительность с точки зрения ARI в этих сценариях (рис. 1h и дополнительный рис. 7).
Поскольку некоторые методы были оптимизированы для обнаружения редких типов клеток, мы проверили, эффективны ли гены, выбранные с помощью нашей модели S – E, для выявления таких редких субпопуляций. С этой целью мы сначала смоделировали набор данных scRNA-seq («Методы»), который содержит три редких кластера (по 10, 30 и 20 ячеек соответственно) и два общих кластера (по 1000 ячеек каждый), и сгруппировали эти ячейки. с GiniClust2 18 , RaceID3, а также с Seurat на основе модели S – E («Методы»).Следует отметить, что все эти три метода правильно резюмировали пять кластеров ячеек (дополнительный рис. 8), указывая на то, что Сера, основанный на модели S – E, действительно эффективен для восстановления как общих, так и редких кластеров ячеек. Помимо смоделированных данных, мы поинтересовались, как ведет себя модель S – E при обнаружении реальных редких типов клеток. Поскольку для таких случаев не существует золотого стандарта, мы рассмотрели четыре клеточные линии (A549, h3228, H838 и HCC827) Tian et al. 6 , и сгенерировал три распространенных типа клеток (A549, h3228 и H838; по 500 клеток для каждого) и один редкий тип клеток (HCC827; из 20 или 10 клеток соответственно) путем понижающей выборки.Подобно анализу смоделированных данных, все три метода эффективно идентифицировали как обычные, так и редкие кластеры клеток, когда было 20 клеток редкого типа клеток (дополнительный рис. 9a – c). Для набора данных с редким типом клеток, составляющим более низкую частоту (здесь 10 ячеек, 0,6% от общего количества ячеек), RaceID3 и GiniClust2 продемонстрировали свое превосходство в обнаружении редкого типа ячеек по сравнению с моделью Сера на основе S – E (дополнительный рис. 9г – е). Таким образом, хотя модель S – E в определенной степени эффективна для выявления редких субпопуляций, методы, специально разработанные для этой цели, такие как GiniClust2 и RaceID3, могут быть более подходящими.
Оценка устойчивости ROGUE
Чтобы проверить, насколько чувствительна ROGUE к выбору информативных генов, здесь мы рассмотрели два набора данных scRNA-seq: набор данных Т-клеток, секвенированный с помощью Smart-seq2 5 , и набор данных на основе капель 2 (Табула Мурис). Результаты показали, что показатель гетерогенности (1-ROGUE) достиг насыщения, когда были выбраны гены со значительными ds (дополнительный рис. 10), поэтому мы использовали значимые ds для вычисления ROGUE в следующих анализах.Мы исследовали эффективность ROGUE на 1860 популяциях клеток, смоделированных на основе распределения NB и ZINB (2000 клеток × 20 000 генов каждый), при этом 0,1–50% генов варьировали во втором типе клеток («Методы»). Популяция клеток как с меньшим количеством проникающих чужеродных клеток, так и с различными генами даст оценку высокой чистоты, в то время как популяция с противоположной ситуацией, как ожидается, даст оценку низкой чистоты. Видно, что индекс ROGUE монотонно уменьшался с увеличением неоднородности клеточных популяций (рис.2а, б и дополнительные рис. 11 и 12). ROGUE работал хорошо, даже когда клеточные популяции содержали несколько различных генов (<1%) и инфильтрирующие клетки (<1%), что указывает на то, что индекс ROGUE обеспечивает чувствительную и непредвзятую меру в зависимости от степени чистоты клеточной популяции. Использование различных значений эталонного коэффициента K («Методы») дало разные аналогичные результаты (дополнительный рисунок 13), предполагая, что ROGUE устойчив к выбору параметра K в разумных пределах.
Рис. 2: Использование и производительность ROGUE.
a Индекс ROGUE (референсный фактор K = 45) монотонно уменьшается с увеличением количества различных генов в каждой моделируемой смеси, состоящей из двух типов клеток (1: 1). Центральная линия указывает среднее значение ROGUE n = 50 повторных симуляций. Нижний и верхний шарниры представляют 25-й и 75-й процентили соответственно, а усы обозначают 1,5-кратный межквартильный размах. b Значения ROGUE (контрольный коэффициент K = 45) для смоделированных смесей с размерами ячеек в диапазоне от 1: 100 до 1: 1.В каждой смеси количество различных генов составляло 1% от общего количества генов ( n = 20 000). Центральная линия указывает среднее значение ROUGE n = 50 повторных симуляций. Нижний и верхний шарниры представляют 25-й и 75-й процентили соответственно, а усы обозначают 1,5-кратный межквартильный размах. c Корреляции Пирсона для S между случайно выбранными наборами данных ( n = 50 прогонов для каждого) и полными наборами данных (2000 ячеек), смоделированными из распределения NB и ZINB.Центральная линия указывает среднее значение корреляции. Нижний и верхний шарниры представляют 25-й и 75-й процентили соответственно, а усы обозначают 1,5-кратный межквартильный размах. d Распределение глубины секвенирования (общее количество UMI по клеткам) для двух смоделированных повторов. Реплика 2 имеет глубину секвенирования в десять раз больше, чем реплика 1. e График S – E смеси реплик 1 и 2 показан в d . f Значения ROGUE для n = 100 смесей в сравнении со значениями силуэта для каждых двух повторов в отдельных смесях.Высокое значение силуэта указывает на существенную разницу в глубине секвенирования между двумя повторами. g , h Графики S – E и соответствующие значения ROGUE для 10 популяций клеток из набора данных PBMC 24 . i Оценка чистоты шести популяций Т-клеток человека. j Оценка чистоты ДК, инфильтрирующих рак легкого, где каждая точка представляет пациента. Центральная линия указывает среднее значение ROUGE. Нижняя и верхняя петли представляют 25-й и 75-й процентили соответственно, а усы обозначают 1.В 5 раз больше межквартильного размаха.
Чтобы устранить потенциальную озабоченность по поводу того, что количество ячеек может представлять собой внутреннюю проблему для расчета S и ROGUE, особенно если только небольшое количество ячеек отбирается из данных образцов, мы выполнили анализ выборки с понижением, чтобы проверить, как ячейка повлияла на S. числа. Вычислив корреляции Пирсона для S между случайно отобранными наборами данных и всеми наборами данных, мы нашли значения подобия> 0,99 и продемонстрировали, что на наш расчет S и ROGUE не повлияет изменение количества ячеек (рис.2в).
Глубина секвенирования может значительно варьироваться в зависимости от клетки, с вариациями, потенциально охватывающими порядки величины 2 , и, следовательно, вносит существенный вклад в техническую путаницу в данных scRNA-seq. Мы стремились исследовать, может ли индекс ROUGE точно оценить чистоту одноклеточной популяции с учетом этого технического эффекта. В качестве тестовых примеров мы смоделировали увеличение количества молекул (глубины секвенирования) во второй имитации репликации, при этом кратное изменение средних значений экспрессии генов варьировалось от 2 до 100 (рис.2г и «Методы»). Несмотря на значительный технический эффект, ожидается, что смесь каждых двух смоделированных повторов будет чистой популяцией клеток. Здесь мы использовали силуэт, чтобы измерить степень различий между репликами. Результаты показали значения ROGUE ~ 0,99–1 для каждой популяции, состоящей из двух повторов, со значениями силуэта в диапазоне от 0,25 до 0,75 (рис. 2e, f и дополнительный рис. 14a). Таким образом, ROGUE не только предлагает надежный и чувствительный способ оценки чистоты одноклеточной популяции, но также учитывает различия в глубине секвенирования.
ROGUE точно оценивает чистоту клеточных популяций
Чтобы проиллюстрировать применимость индекса ROGUE к реальным данным, мы сначала рассмотрели набор данных Консорциума внешнего контроля РНК (ERCC) 24 , который представляет собой строго контролируемый эксперимент, посвященный пониманию технических характеристик. изменчивость. Все 1015 капель этого набора данных получили одинаковое соотношение синтетических РНК ERCC, поэтому в принципе не следует обнаруживать различные РНК. Мы назвали этот набор данных идеальным случаем чистой клеточной популяции и нашли только одну РНК со значительными ds .Соответственно, этот набор данных ERCC достиг значения ROGUE ~ 1, как и ожидалось, что подтверждает его чистоту. Кроме того, мы исследовали свежие мононуклеарные клетки периферической крови (PBMC), обогащенные от одного здорового донора 24 . Авторы предоставили несколько типов клеток, очищенных с помощью FACS, и, таким образом, представляют собой подходящий ресурс для оценки чистоты. Эти типы клеток на рис.2g, включая наивные Т-клетки CD4 / CD8 и Т-клетки памяти CD4, оказались высокогомогенными популяциями 27 , и были обнаружены высокие значения ROGUE (0.94–1), как и ожидалось. Напротив, как моноциты CD14, так и клетки CD34 + представляют собой смеси различных подтипов 24 и получили относительно низкие значения ROGUE (~ 0,8; рис. 2h), что подтверждает их гетерогенность.
Помимо строго контролируемых наборов данных, также поучительно исследовать, как индекс ROGUE работает с чистыми подтипами, идентифицированными неконтролируемой кластеризацией. Здесь мы сначала рассмотрели шесть четко определенных подтипов Т-клеток колоректального рака человека 5 , которые были созданы с помощью протокола Smart-seq2.Все эти чистые подтипы достигли высоких значений ROGUE> 0,9 (рис. 2i) по сравнению с 0,78 для полных данных (дополнительный рис. 14b). Затем мы исследовали четыре подмножества дендритных клеток (ДК), собранные из рака легких человека 28 и секвенированные с помощью платформы inDrop. В частности, было доказано, что инфильтрирующие опухоль клетки DC2 представляют собой весьма гетерогенные популяции 29,30 и существенно отклоняются от других гомогенных типов клеток, включая DC1, LAMP3 + DC и pDC (рис. 2j). Взятые вместе, эти результаты показывают, что наш ROGUE представляет собой эффективную и прямую количественную оценку чистоты клеточной популяции без влияния технических характеристик.
Анализ на основе ROGUE улучшает идентификацию типов клеток
Далее мы оценили потенциал ROGUE для управления кластерным анализом с силуэтом, который исследует, максимизирует ли определенная кластеризация межкластерное несходство и минимизирует ли внутрикластерное несходство. В качестве тестового примера мы смоделировали набор данных scRNA-seq, состоящий из трех типов клеток A, B и C (подробности см. В разделе «Методы»), где типы клеток A и B были подобными подтипами с 1% разнообразных генов. Мы сгруппировали этот набор данных в 2, 3, 4 и 5 субпопуляций соответственно, настроив параметр разрешения в Seurat 23 (рис.3а), затем оценили результаты, проверив соответствующий силуэт и средние значения ROGUE. Правильная кластеризация этого набора данных должна привести к трем субпопуляциям, по одной для каждого типа ячеек. Тем не менее, силуэт получил максимальное значение, когда тип клеток A объединялся с B (рис. 3b), то есть когда были идентифицированы только два кластера, что позволяет предположить, что такой показатель плохо интерпретируется для чистоты кластера в отличие от ROGUE, который достиг насыщения. когда было три кластера (рис. 3в). Повторение моделирования с различными различиями в типах ячеек A, B и C дало эквивалентную производительность для этих двух методов (дополнительный рис.15а – е). Такие характеристики также наблюдались при использовании различных значений эталонного коэффициента K (дополнительный рисунок 16). Поскольку ROGUE может обеспечить прямую количественную оценку чистоты одного кластера и не зависит от методов, используемых для нормализации, уменьшения размерности и кластеризации, его также можно применять для управления разделением (повторной кластеризацией) или слиянием определенных кластеров в неконтролируемом кластерном анализе.
Рис. 3: ROGUE улучшает кластеризацию отдельных ячеек и идентификацию типов ячеек.
a t-SNE графики смоделированного набора данных, содержащего три типа ячеек. Соответствующие значения силуэта ( b ) и средние значения ROGUE (c) при наличии 2, 3, 4 и 5 предполагаемых кластеров соответственно. d UMAP-графики фибробластов, связанных с раком легких, с цветовой кодировкой кластеров в исходной бумаге (слева; дополнительный рис. 17a) и перекрестно сгруппированных меток (справа). e ROGUE значения различных кластеров до (слева) и после (справа) повторной кластеризации.Каждая точка представляет пациента. Центральная линия указывает среднее значение ROUGE. Нижний и верхний шарниры представляют 25-й и 75-й процентили соответственно, а усы обозначают 1,5-кратный межквартильный размах. f UMAP — график уровней экспрессии MYh21 и MEF2C . г Различия в активности основных путей, оцененные с помощью GSVA.
Чтобы проверить, как ROGUE может помочь в кластеризации реальных наборов данных, мы изучили ранее опубликованный набор данных о связанных с раком фибробластах (CAF) 31 из опухолей легких.Сообщалось, что CAF представляют собой весьма гетерогенную популяцию и могут играть поддерживающую опухоль роль в микроокружении опухоли 32 . Мы обнаружили, что семь идентифицированных кластеров фибробластов получили низкие значения ROGUE (рис. 3d, e и дополнительный рис. 17a). Поэтому мы выполнили анализ повторной кластеризации с целью изучения степени неоднородности и идентифицировали в общей сложности 11 кластеров с более высоким средним значением ROGUE (рис. 3d, e). В дополнение к двум классическим подтипам CAF (миофибробластные CAF и воспалительные CAF) мы также обнаружили наличие антиген-презентирующих CAF (apCAF), которые характеризовались высокой экспрессией генов CD74, и MHC класса II (дополнительный рис. .17б). ApCAF были впервые обнаружены как подтип фибробластов в протоковой аденокарциноме поджелудочной железы мыши (PDAC), но едва обнаруживаются в PDAC человека без образования отдельного кластера 33 . Значительное присутствие apCAFs при раке легких, таким образом, может указывать на потенциальные различия между различными типами рака.
Кроме того, мы отметили, что myCAF (AF_C02_COL4A1, ROGUE = 0.81), идентифицированные первоначальными авторами, могут быть далее разделены на три отдельные субпопуляции, включая BF_C01_RGS5 (ROGUE = 0.84), BF_C02_ACTA2 (ROGUE = 0,87) и BF_C03_GPX3 (ROGUE = 0,94). Интересно, что сигнатурные гены AF_C02_COL4A1, описанные первоначальными авторами, действительно были специфичны для одной из этих трех субпопуляций, включая MEF2C, в BF_C01_RGS5 и MYh21, в BF_C02_ACTA2 (рис. 3f). Анализ путей также показал, что передача сигналов NOTCH активируется в BF_C01_RGS5 (Fig. 3g), а не в общем сигнале AF_C02_COL4A1 31 . Несмотря на значительное увеличение общего индекса ROGUE, BF_C00_AOL10A1, BF_C04_COL1A2 и BF_C05_PLA2G2A по-прежнему получили относительно низкие значения ROGUE, что требует дальнейшего изучения.В целом, анализ под руководством ROGUE не только обнаружил новые подтипы клеток, но также позволил выявить истинные сигналы в конкретных чистых субпопуляциях.
Анализ под руководством ROGUE идентифицирует чистые подтипы В-клеток
В-клетки являются ключевыми компонентами в микросреде опухоли, но имеют неясные функции в противоопухолевом гуморальном ответе 34 . Здесь мы исследовали ранее сообщенные В-клетки 31,35 , инфильтрирующие опухоли печени и легких, и обнаружили, что они получили относительно низкие значения ROGUE (рис.4а). Таким образом, мы применили дальнейший кластерный анализ в сочетании с ROGUE к этим В-клеткам в попытке обнаружить чистые подтипы. Всего было идентифицировано семь кластеров, каждый со своими специфическими генами-маркерами (рис. 4b – d). Клетки из первой подгруппы B-клеток, B_C0_JUNB, специфически экспрессировали гены-сигнатуры, включая JUNB и FOS , таким образом представляя активированные B-клетки 36 . Вторая подгруппа, B_C1_TXNIP, показала высокую экспрессию генов пути гликолиза (дополнительная таблица 4), что указывает на его метаболические различия. ACTB , ген, участвующий в представлении антигена, был высоко экспрессирован в третьей подгруппе (B_C2_ACTB). Анализ активности пути также выявил сильный сигнал процессинга и презентации антигена в этой подгруппе (дополнительная таблица 4). Четвертый кластер, B_C3_FCER2, характеризующийся высокой экспрессией HVCN1 и генов, участвующих в сигнальном пути рецептора B-клеток (дополнительная таблица 4), в основном состоит из предварительно активированных B-клеток 37 . Пятый кластер, B_C4_MX1, преимущественно состоящий из индуцированных интерфероном В-клеток 38 , экспрессировал высокие уровни MX1 , IFI6 и IFI44L .Шестой кластер, B_C5_CD3D, экспрессировал ключевые маркеры как Т-, так и В-клеточных клонов (фиг. 4d), таким образом, возможно, двойные экспрессирующие (DE) -подобные лимфоциты 39 или дублеты. Остальные B-клетки, попавшие в седьмой кластер, B_C6_LRMP, демонстрировали высокую экспрессию LRMP и RGS13 , что указывает на идентичность B-клеток зародышевого центра 40 .
Рис. 4: Анализ под руководством ROGUE для идентификации чистых подтипов В-клеток.
a S – E графики и значения ROGUE B-клеток, инфильтрирующих опухоль печени и легкого, соответственно.Графики UMAP 4291 B-клеток, обозначенных цветом по их ассоциированным кластерам ( b ) и тканям ( c ). d Тепловая карта экспрессии генов семи кластеров В-клеток. Строки обозначают маркерные гены, а столбцы обозначают различные кластеры. e ROGUE значений семи идентифицированных подтипов B-клеток. Каждая точка представляет пациента. Центральная линия указывает среднее значение ROUGE. Нижняя и верхняя петли представляют 25-й и 75-й процентили соответственно, а усы обозначают 1.В 5 раз больше межквартильного размаха. f Тканевое предпочтение каждого подтипа В-клеток при раке печени оценивается с помощью RO / E 27 , отношения наблюдаемого количества клеток к ожидаемому, рассчитанного с помощью теста хи-квадрат. г Средние фракции B_C02_ACTB и B_C04_MX1 у каждого пациента по тканям, где полосы ошибок представляют ± s.e.m. * p <0,05, ** p <0,005, тест Стьюдента t . Кривые Каплана-Мейера пациентов с TCGA LUAD ( h ) и LIHC ( i ) сгруппированы по 13 маркерам (дополнительная таблица 5) B_C02_ACTB.
Как DEs / дублеты, так и B-клетки с зародышевым центром показали низкие значения ROGUE (рис. 4e), но ограниченные клетки не допускали дальнейшей кластеризации. Для В-клеток зародышевого центра мы легко обнаружили высокую экспрессию пролиферирующих маркерных генов, включая MKI67 и STMN1 (дополнительный рис. 18), во фракции этих клеток, что в некоторой степени объясняет гетерогенность. В отличие от этих двух кластеров, мы обнаружили значения ROGUE> 0,92 для каждого из оставшихся пяти кластеров (рис.4e), демонстрируя, что все они были высокооднородными подтипами B-клеток. Вычисляя отношение наблюдаемого количества клеток к ожидаемому с помощью теста хи-квадрат (RO / E), мы отметили, что и B_C02_ACTB, и B_C04_MX1 содержали в основном клетки опухоли со значениями RO / E> 1 (рис. 4f). Подобные анализы, стратифицированные по пациентам, дополнительно подтвердили эту тенденцию (рис. 4g). Основываясь на независимом наборе данных когорты аденокарциномы легкого TCGA (LUAD), пациенты с более высокой экспрессией маркерных генов B_C02_ACTB (нормализованные с помощью MS4A1; дополнительная таблица 5) показали значительно худшую общую выживаемость (рис.4ч). Такая разница в выживаемости также наблюдалась в наборе данных когорты гепатоцеллюлярной карциномы печени (LIHC) TCGA (рис. 4i). Таким образом, клиническое значение заслуживает дальнейшего изучения, чтобы выяснить, какую конкретную роль клетки B_C02_ACTB играют в микросреде опухоли. Таким образом, определение чистых подтипов с помощью анализа на основе ROGUE может позволить более глубокое биологическое понимание состояния и поведения клеток.
Применение к данным мозга и оценке эффекта партии
Помимо данных о раке, мы также продемонстрировали применение ROGUE для анализа набора данных транскриптома мозга 2 , который имеет высокую степень гетерогенности для этих инкапсулированных классов клеток.Этот набор данных идентифицировал семь различных типов клеток, из которых типы олигодендроцитов и нейронных клеток имели низкие значения ROGUE <0,8, по сравнению с ~ 0,9–1 для остальных пяти классов клеток (рис. 5a). Поэтому мы применили дальнейшую кластеризацию под руководством ROGUE к олигодендроцитам, который состоит из достаточного количества клеток ( n = 3401), и идентифицировали десять уточненных подтипов клеток, каждый со своими специфическими генами-маркерами (рис. 5b, c). За исключением кластера 6, мы нашли значения ROGUE ~ 0,9–1 для всех остальных девяти кластеров, что свидетельствует об их чистоте (рис.5г). Чтобы изучить потенциальные функции этих подтипов, мы сравнили активность путей и обнаружили значительное фенотипическое разнообразие. Напр., Кластер 5 показал сильный сигнал передачи сигналов аксонов (рис. 5e), тогда как путь передачи сигналов нейротрофина был сильно активирован в кластере 1 (рис. 5f). Этот пример дополнительно иллюстрирует, как ROGUE играет ключевую роль в выявлении чистых субпопуляций.
Рис. 5: Применение ROGUE в данных мозга и оценке эффекта партии.
a ROGUE значений семи различных типов клеток мозга, как определено в исходной публикации 2 , где каждая точка представляет собой образец.Центральная линия указывает среднее значение ROUGE. Нижний и верхний шарниры представляют 25-й и 75-й процентили соответственно, а усы обозначают 1,5-кратный межквартильный размах. b График UMAP десяти идентифицированных кластеров олигодендроцитов ( n = 3401), обозначенных цветом по их ассоциированным кластерам. c Тепловая карта экспрессии специфичных для клеточного типа генов десяти кластеров олигодендроцитов. d ROGUE значений кластеров олигодендроцитов. Каждая точка представляет собой образец.Центральная линия указывает среднее значение ROUGE. Нижний и верхний шарниры представляют 25-й и 75-й процентили соответственно, а усы обозначают 1,5-кратный межквартильный размах. e , f Обогащенные пути для кластера 5 ( e ) и кластера 1 ( f ) соответственно. г Значения ROGUE были показаны для партии 1 (контрольная группа), партии 2 (группа стимуляции) и агрегированной популяции клеток (партии 1 и партии 2) для каждого типа клеток. Для честного сравнения мы выровняли количество ячеек в каждой группе с помощью понижающей выборки.Центральная линия указывает среднее значение ROGUE. Нижний и верхний шарниры представляют 25-й и 75-й процентили соответственно, а усы обозначают 1,5-кратный межквартильный размах. * p <0,05, ** p <0,005, тест Стьюдента t . ч Значения ROGUE для индивидуальных популяций клеток и агрегированных популяций (все индивидуумы). Все использованные здесь клетки были из контрольной группы. Подвыборка была проведена, чтобы уравнять количество ячеек в каждой группе.Центральная линия указывает среднее значение ROUGE. Нижний и верхний шарниры представляют 25-й и 75-й процентили соответственно, а усы обозначают 1,5-кратный межквартильный размах. * p <0,05, ** p <0,005, тест Стьюдента t .
Чтобы выяснить, эффективен ли ROGUE для оценки влияния пакетного эффекта, мы изучили набор данных о человеческих PBMC, содержащих несколько различных типов клеток 38 . Клетки из этого набора данных ранее были разделены на две группы — группу, стимулированную интерфероном-бета (IFN-β), и контрольную группу, подобранную по культуре, поэтому их можно рассматривать как две партии.Затем мы применили ROGUE для оценки чистоты каждого типа клеток (как определено исходными авторами) в отдельных ваннах, а также агрегированной популяции клеток (партия 1 и партия 2) и обнаружили, что ROGUE обнаружил значительное снижение чистоты в агрегированной группе.